Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip1Q922J3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms