Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx18Q91ZR2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx18Q91ZR2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx18Q91ZR2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx18Q91ZR2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx18Q91ZR2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms