Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pde6cQ91ZQ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pde6cQ91ZQ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pde6cQ91ZQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pde6cQ91ZQ1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pde6cQ91ZQ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6cQ91ZQ1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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