Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms