Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Setd3Q91WC0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd3Q91WC0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd3Q91WC0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd3Q91WC0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd3Q91WC0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd3Q91WC0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Setd3Q91WC0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms