Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms