Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx1Q91V10 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms