Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cabp4Q8VHC5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms