Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenomQ8VHC3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms