Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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