Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71Q8VEG0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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