Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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