Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgtbQ8VD33 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms