Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Fam20bQ8VCS3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam20bQ8VCS3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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