Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms