Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300ldQ8VCH2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300ldQ8VCH2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms