Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nxnl1Q8VC33 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nxnl1Q8VC33 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms