Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk8Q8R3L8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms