Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim29Q8R2Q0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms