Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg10Q8R1P4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms