Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Treml1Q8K558 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms