Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc5Q8K4Z2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc5Q8K4Z2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms