Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms