Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolbQ8K409 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms