Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MyripQ8K3I4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms