Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms