Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms