Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Trappc12Q8K2L8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Trappc12Q8K2L8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Trappc12Q8K2L8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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