Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd3Q8K2C9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms