Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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