Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtmr3Q8K296 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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