Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms