Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Nek9Q8K1R7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Nek9Q8K1R7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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