Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms