Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms