Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FgbQ8K0E8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms