Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp1Q8K021 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms