Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms