Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Card11Q8CIS0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Card11Q8CIS0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Card11Q8CIS0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Card11Q8CIS0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms