Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trpm6Q8CIR4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trpm6Q8CIR4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpm6Q8CIR4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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