Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms