Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rdh13Q8CEE7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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