Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pramef8Q8CE24 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pramef8Q8CE24 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pramef8Q8CE24 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Pramef8Q8CE24 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef8Q8CE24 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms