Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc63Q8CDV6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms