Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms