Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stbd1Q8C7E7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms