Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc187Q8C5V8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc187Q8C5V8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc187Q8C5V8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc187Q8C5V8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc187Q8C5V8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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