Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdrpQ8C5P7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdrpQ8C5P7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms