Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cwc22Q8C5N3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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