Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sfrp1Q8C4U3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sfrp1Q8C4U3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sfrp1Q8C4U3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms